โดยประเทศเป้าหมายแรกคือจีน ซึ่งสนใจพัฒนาอุตสาหกรรมเทคโนโลยีและนวัตกรรมเช่นเดียวกับไทย และยังสนใจเข้ามาลงทุนในไทย ส่วนประเทศเป้าหมายที่สองคืออินเดีย ซึ่งต้องการให้ไทยเปิดตลาดวิชาชีพ เช่น แพทย์ วิศวกร วิทยาศาสตร์และเทคโนโลยี  ในขณะที่อินเดียสนใจให้ไทยเข้าไปพัฒนาด้านบริการต่าง ๆ เช่น การท่องเที่ยว การโรงแรม อุตสาหกรรมก่อสร้าง นอกจากนี้ยังเตรียมหารือทวิภาคีลักษณะดังกล่าวกับประเทศในกลุ่ม CLMV (กัมพูชา ลาว เมียนมา เวียดนาม) เพื่อเพิ่มยอดการส่งออกของไทยและเกิดผลดีในด้านการสร้างสัมพันธ์เชิงลึกระหว่างกัน อย่างไรก็ตามโครงการดังกล่าวจะดำเนินการควบคู่ไปกับการเจรจาจัดทำข้อตกลงเอฟทีเอด้วย 

          ด้าน ดร.สุวิทย์ เมษินทรีย์ รมช.พาณิชย์ กล่าวว่าในการเจรจาหุ้นส่วนยุทธศาสตร์ทวิภาคี ได้แบ่งกลุ่มประเทศที่จะเจรจาไว้ 3 กลุ่ม คือ 1.กลุ่ม CLMV เน้นการพัฒนาให้มีความเจริญร่วมกัน ด้วยรูปแบบความร่วมมือแบบรัฐต่อรัฐ ในการช่วยเหลือการลงทุนด้านโครงสร้างพื้นฐาน เช่น การสร้างถนนเชื่อมโยงใน CLMV โดยมีไทยเป็นเป็นเกตเวย์ 2.จีน อินเดีย ญี่ปุ่น เกาหลีใต้ และสิงคโปร์ เจรจาแลกเปลี่ยนด้านการค้าและการลงทุนในส่วนที่แต่ละฝ่ายมีศักยภาพ และ 3. กลุ่มอื่นๆ เช่น รัสเซีย อิหร่าน ที่มีขีดความสามารถพิเศษในการพัฒนา