สาเหตุจากเปลี่ยนแบบเครื่องบิน จาก B777-300 เป็น B747-400 ทำให้มีชั้นเฟิร์สคลาสเพิ่มเข้ามา และที่นั่งคลาดเคลื่อน แต่ที่นั่งของคณะนักบิน 2 จาก 4 คน ถูกผู้ร้องเรียนและภรรยาจองไว้แล้ว จนมีปัญหาเรื่องขอสลับที่นั่งนั้น ล่าสุดนายศักดิ์ดา ผู้ร้องเรียน ยืนยันว่า หลังเกิดเรื่อง ได้ยื่นคำร้องเรียนตามช่องทางปกติของการบินไทย หวังสะท้อนถึงปัญหาที่เกิดขึ้น จนผู้บริหารการบินไทยติดต่อเข้ามา และขอเข้าพบ เพื่อพูดคุยถึงปัญหาในวันที่ 22 ตุลาคมนี้ แต่สุดท้ายเนื้อหาในคำร้องเรียนดังกล่าว กลับหลุดออกมาในสังคมออนไลน์ ซึ่งตรงนี้เป็นเรื่องแปลก และเป็นที่น่าสังเกตว่า ภายในของการบินไทย มีความขัดแย้งกันเองหรือไม่ ขณะที่นายสุเวช กาญจน์วีระโยธิน ผู้จัดการเที่ยวบินอาวุโส ปฏิบัติหน้าที่เที่ยวบินดังกล่าว ทำบันทึกถึงผู้อำนวยการ ฝ่ายมาตรฐานและบริหารงานทั่วไป โดยรายงานเหตุความล่าช้าว่า เมื่อแจ้งที่นั่งของคณะนักบิน 4 คน เป็นหมายเลข 16A-B และ 16J-K ที่เป็นที่นั่งชั้นธุรกิจแล้ว ทางกัปตันผู้มีอำนาจ ปรึกษาเจ้าหน้าที่ภาคพื้น ขอเปลี่ยนที่นั่งให้นักบิน 2 คน กระทั่งเวลาผ่านไปนาน 2 ชั่วโมง จึงเปลี่ยนที่นั่งได้ ซึ่งระหว่างเที่ยวบิน ได้พูดคุยกับผู้ร้องเรียนและภรรยา และอธิบายให้เข้าใจว่า เป็นการเปลี่ยนที่นั่งในชั้นบริการตามตั๋วโดยสาร ไม่ได้เพิ่มหรือลดสิทธิใดๆ ซึ่งบุคคลทั้ง 2 เข้าใจเป็นอย่างดี พร้อมบอกกลับว่า ถ้าขอร้องตั้งแต่แรก ก็ยินดีสละที่นั่งให้ทันที แต่เสียความรู้สึก หลังได้รับข้อความจากเจ้าหน้าที่ภาคพื้น ทำนองว่า “นักบินต้องการที่นั่งของท่าน ถ้าไม่เปลี่ยนที่นั่ง เครื่องจะออกไม่ได้ และขอร้องผู้โดยสารท่านอื่นแล้ว ไม่มีใครยอมเปลี่ยน” แต่จากการสอบถามผู้โดยสารอีก 7 ท่าน ที่นั่งในโซนเฟิร์สคลาส ซึ่งถูกเพิ่มเข้ามา พบว่าไม่มีท่านใดสำรอง และระบุที่นั่งด้วยตัวเอง รวมถึงไม่มีท่านใดได้รับการติดต่อจากเจ้าหน้าที่ภาคพื้นดิน เพื่อขอเปลี่ยนที่นั่งเลย ประกอบกับในห้องโดยสาร ไม่มีพนักงานให้บริการเต็มที่ จึงทำให้ความเข้าใจคลาดเคลื่อน และมีปัญหาดังกล่าว